Математические модели в естественнонаучном образовании. Том II. Денис Владимирович Соломатин
для самостоятельного решения:
5.3.1. Перед проработкой примера, в целях более глубокого понимания метода присоединения соседей, полезно вывести формулы используемые на шаге 2 и 3 изложенного алгоритма. Предположим, что решили объединить
а. Покажите, что на шаге 2 расстояния от
Затем покажите, что вторая из этих формул может быть заменена на
б. Покажите, что на шаге 3 расстояния от
Таблица 5.11. Расстояния между таксонами для задачи 5.3.2
.83 .28 .41
.72 .97
.48
5.3.2. Рассмотрим данные о расстояниях, приведенные в таблице 5.11. Используйте алгоритм присоединения соседей для построения дерева следующим образом:
а. Вычислите
б. Если правильно справились с частью (а), то должно получиться несколько пар, имеющих одинаковое наименьшее значение
Для новой вершины
в. Вычислите
Поместите свои ответы в новую версию таблицы расстояний 5.12.
г. Поскольку осталось только 3 таксона, используйте 3-точечные формулы, чтобы поместить
д. Нарисуйте последнее дерево, присоединив
Таблица 5.12. Групповые расстояния для задачи 5.3.2
? ?
.72
Таблица 5.13. Расстояния таксонов для задачи 5.3.3